１、序章
Where：西地中海
When：自动发生
Who：萨尔瓦多·雷依斯、霍勒斯、艾丁、约卡
How ：固定单挑，胜负无妨
Wny ：主人公萨尔瓦多是西地中海海盗组织首领，海勒丁（即II中神通广大的红胡子海盗）的亲子，向往父亲一样在广大的海洋上一显身手！于是在副手霍勒斯帮助下私自驾船出海，战斗后出现的海盗组织二号人物艾丁（即II中横行地中海的黑胡子）和海盗新秀约卡的奉海勒丁之命带萨尔瓦多回去的，约卡一直和萨尔瓦多互为事业上的假想敌，因此只要他们两人同时出现必然会火药味十足。
２、通向海洋之路
Where：阿尔及尔
When：紧接上一事件
Who：海勒丁·雷依斯、刚萨雷斯·比戈尔、罗德里格斯·比戈尔
How :1、进入海盗本部，固定情节。
2、从海盗本部出来后，即可在船场中获得船只。
3、出海盗本部后从旅店大娘处获得5瓶圣香油。
4、出海盗本部后在某一场所会听到海盗头领多戈尔在主角的消息，此后回海盗本部会获得较强装备。
5、要出港时比戈尔兄弟出现，此后前往酒吧详谈，之后即可出港。
Wny ：海盗本部中正在进行的是针对萨尔瓦多私自出航事件的讨论。众多海盗头领中似乎只有多戈支持萨尔瓦多，萨尔瓦多则强烈地向父亲提出了让自己正式成为一个海盗的请求。让众人倍感意外的是父亲力排众议答应了他的要求，在出口处约卡又来挑衅一番，两人以后才真正成了事业上的竞争对手。在萨尔瓦多离去后，海勒丁和艾丁的谈话中提到了“那件事”，他们之间似乎存在着不为萨尔瓦多所知的秘密……
比戈尔兄弟向主角交待了海盗中的上纳金制度，即在声望达到一定程度时收取所持金的1/2作为上纳金，如果金额足够即可提升海盗等级（相当于爵位），在成为最高等级——英雄后则可停止上缴。
３、朋友
Where：塞维利亚
When：海盗声望3000（以下数字相同）
Who：里渥诺·阿邦吉拉
How :1、在某港得到消息即前往塞维利亚。
2、在塞维利亚的旅馆中到里渥诺并自动加入对伍。
Wny ：里渥诺是父亲派来辅佐萨尔瓦多的，其言行都表现出了极高的热情，特别是以热烈的一吻作为见面礼更是让萨尔瓦多和霍勒斯咳然失，而老道的霍勒斯对他到来充满了怀疑。
４、奇怪的同行
Where：那布勒斯附近海面
When:5000
Who：雅科布、米兰达、安娜
How :1、某码头里渥诺提出到塞乌塔搜集情报。
2、在休达港酒吧中获得情报。
3、到达那布勒
斯后再出港即发生舰队战。
Wny ：通过酒吧获得“大鱼”的消息是海盗们惯用的手法，休达港的酒吧女对萨尔瓦多颇具好感，但萨尔瓦多似乎对女性怀有莫名的恐惧，此后在那布勒斯出港所懈逅米兰达时（游戏中的另一女主角，冒傻气的女探险家），他又一表现出了对女性的恐惧，以至忘记出港而逃出了出港所。第二次才得以出港的萨尔瓦多终于能够发挥自己的专长，打败了豪华和不堪一击的程度都足以使人吃惊的雅科布海盗舰队。
５、竞争——夏尔克前哨战
Where：阿尔及尔
When:9000
Who：乌尔古·阿里、瑞贝卡·加特朗多、艾尔·威萨斯
How :1、在某港口得知父亲在寻主角，于是前往阿尔及尔。
2、在海盗本部接受任务。
3、在两个月内获得尽量多的海盗声望（6000以上为宜）
4、在霍勒斯告知到期后回阿尔及尔，取得征讨乌尔古舰队的任务。
5、到休达港安娜处打听消息，得知旅店里的商人可能知道乌尔古舰队的所在。
6、见到艾尔（II中的商人主角），得知乌尔古舰队在北欧。
7、在领取命令的两个月后在北欧洋面遭遇乌尔古舰队，瑞贝卡舰队会来助战，但务必抢先干掉乌尔古。
8、回休达港又遇到瑞贝卡（瑞贝卡是北欧海战中出现的赏金猎手）。
9、回阿尔及尔复命。
Wny ：终于到了和东地中海海盗们决一雌雄的时候了。首先要作的是消灭东地中海海盗首领夏尔克的得力干将，也就是正要于奥斯曼帝国舰队合流的乌尔古。但这项任务要交给在“两个月竞争”的胜利者…
…萨尔瓦多和约卡第一次展开了真正的较量。
成功干掉了乌尔古的主角在休达港酒吧再此遇到她时，她会埋怨主角抢走了本来属于她的钱。另一方面，萨尔瓦多在得到父亲的奖赏后（奖给他一把为＊级的瑞士刺剑），又和约卡打起了嘴巴官司，约卡虽然输掉了两个月前的竞争，但声称自己一定会在以后和夏尔克的决战中挽回名誉。
（注：此次如果海盗声望比他少，就会让你去打奥斯曼帝国舰队，你去休达港酒吧安娜处打听消息，得知旅店里的地图画家洛佩斯（II中的海上学者）可能知道奥斯曼帝国舰队所在。见到洛佩斯后，得知奥斯曼帝国舰队在阿尔金岛。在领取命令的两个月后在阿尔金岛洋面遭遇奥斯曼帝国舰队，歼灭奥斯曼帝国舰队后，去休达港安娜处，再去海盗总部。从海盗总部出来后，在码头遇见比戈尔他会让你去新大陆打卡特琳娜（II中的女海盗）。在开云港外，与卡特琳娜遭遇。之后，霍勒斯告诉回地中海）
６
、火药之旅
Where：长安港
When:17000
Who：夏尔克、沃尔夫、加斯巴尔、王秀迅
How :1、在某港霍勒斯提醒萨尔瓦多该回阿尔及尔看看了。
2、在海盗本部偷听到谈话后于凌晨2—4点出港。
3、在尼科西亚向夏尔克发起攻击。
4、败退后前往汉堡。
5、在汕头按酒店、道具店、出港所的顺序打听火药的所在。
6、在日本的界到加斯巴尔。
7、在长安被王秀迅逮住，在被加斯巴尔救出后展开强制舰队战，不输即可。
8、回到汉堡。
Wny ：海勒丁和艾尔谈到是和夏尔克决战时的人选问题，萨尔瓦多被指派的任务是到汉堡去干些什么。这使年轻气盛的主角相当不满，于是在里渥诺的怂恿之下，萨尔瓦多直奔尼科西亚而去，但令人吃惊的是奥斯曼帝国的舰队也在这儿，并且敌方的炮火超乎想像的厉害，无奈的萨尔瓦多没脸回阿尔及尔，只好按父亲话里提到的到汉堡去碰碰运气，原来沃尔夫博士一直在海勒丁的委托和赞助之下进
行新式大炮的开发工作，但现在却苦于没有好的火药。于是游戏的舞台第一次离开欧洲，移到了火药的故乡——中国。时值明朝，闭关锁国国策已定，因此王秀迅才大言不愧的要把所有的外国人扔到黄河喂鱼，并高傲的把主角一行人称为野蛮人。（相信如果不是这样的话，推动那大航海时代的应该是中国）。
（注：在来的路上，遇到了英国海军奥托先生，在泉州按酒店、道具店、出港所的顺序打听火药的所在，在日本的界到加斯巴尔后，有可能是在长崎被长谷平藏逮住，在被加巴尔救出后展开强制舰队战，胜利后得到青龙偃月刀和高效火药）。
７、决战？
Where：尼科西亚
When:21000
Who：何塞、艾丝美拉尔达
How :1、在汉堡等待一个月后博士开发出了新式大炮（之后就可以装备重加农炮）。
2、回到阿尔及尔参加战前会议。 又一夜
3、潜入尼科西亚。
4、在尼科西亚被夏尔克发现，在瑞贝卡掩护下出港，固定战斗。
5、战斗后向霍棵斯追问自己母亲的事。
6、回到阿尔及尔寻父亲，展开固定情节，战斗中必须取胜。
Wny ：在军事会议上约卡和多戈被指派主攻任务，而萨尔瓦多则潜入尼科西亚放火制造混乱。此后再合流消灭夏尔克，但主角一行三人同时在尼科西亚遇险，里渥诺抢先一步逃出去向海上的约卡和多戈求救。
在前来取夏尔克性命的瑞贝卡制造的混乱中，萨尔瓦多和霍勒斯也逃了出来。但奇怪的是约卡和多戈的舰队却不见踪影
。这时夏尔克得意洋洋的出现了。原来里渥诺的求救正好中了夏尔克的圈套，前来救助的约卡和多戈舰队遭到了伏击而被全歼，萨尔瓦多只好全力一搏。夏尔克临死前发出了“艾丝美拉尔达，他为什么一点都不像你呢？”这样的悲叹，萨尔瓦多对于夏尔克提到自己的母亲感到困惑不已。逼问之下，霍勒斯才讲出了十几年前发生的事，那时夏尔克还是海勒丁的部下，海勒丁一向对于手下的管理相当严酷。一次，一个海盗为了给妻子治病而私藏了一部分财物，在妻子也就是萨尔瓦多的母亲的苦苦求情声中，
海勒丁还是杀死了那名部下。艾丝美拉尔达忍受不了残酷的丈夫，于是在当晚就和善良的仆人何塞一起离开了阿尔及尔，过起了隐居的生活。
不久，夏尔克也离开了海勒丁。在海勒丁的极力搜寻下，艾丝美拉尔达很快被到，于是就发生了游戏刚开始时发生的那一幕。得知真相的萨尔瓦多兴冲冲地冲回阿尔及尔，却遭到了约卡的暗算，原来约卡将此视为排除竞争对手的一个绝佳的机会，把自己落入夏尔克圈套说成是萨尔瓦多的出卖所致，海勒丁自己心中也有鬼，于是萨尔瓦多就真的被“包装”成了叛徒，所辛萨尔瓦多再次遇见了米兰达！我们的主人公有一次回到了阿尔及尔……
８、哀伤的重逢
Where：斯德哥尔摩
When:30000
Who：里渥诺
How :1、在打败一名海盗后获得传说之铠的情报。
2、在那布勒斯到教授。
3、到休达港酒吧获得珍稀动物的情报。
4、在马达加斯加岛附近到渡渡鸟（Ｓ20，Ｅ50）。
5、回到布勒斯获得地图，指示地上为卑尔根，出港后固定战斗。
6、在卑尔根的旅店与大娘多次交谈后可以获得“恶龙之鳞”。
7、回那布勒斯见教授，再去波尔多。
8、在波尔多的研究所得到“妖精之泪水”的情报，出港后固定战斗。
9、回到波尔多得到“铠的地图”，进出出港所后在酒吧中展开固定战斗。
10、来到斯德哥尔摩，酒吧中固定战斗。
11、来到汉堡，船厂中固定战斗。
Wny ：阿尔及尔的海盗本部已是空无一人，海勒丁已经开始倾其全力搜寻具有惊人武力的洛基之铠（洛基是北欧神话中的火神，邪恶的化身，总与奥丁作对）。在搜寻洛基之铠的过程中，第三次遇见了瑞贝卡，这一次她是冲着我们主人公的赏额来的。
打败了她的萨尔瓦多非常绅士的离开了，这位喜欢冒险的赏金猎人似乎也被感动了，几经周折来到洛基之铠所在地的萨尔瓦多，却遇上了他以为早以死去的好
友——里渥诺，正是里渥诺在波尔多偷走了地图的两个部份并抢先到了洛基之铠，他也被约卡的谎言所欺骗，因此决心和叛徒决一雌雄，临死的他似乎明白了什么，把洛基之铠交给旧日的好友。在汉堡的船厂中展开了父子之间的决斗，被打败的海勒丁终于悔悟了，告诉了萨尔瓦多搜寻“洛基之铠”的真实意途，原来在亚马逊流域发现了古印地安人的海上要塞（也就是II中所谓黄金之国的虚假传说产生的真正根源，葡萄牙的马丁内斯等人在亚马逊河干的正是修复海上要塞的勾当，现在看来海勒丁和马丁内斯，或者说约卡和马丁内斯其实是一伙的），要修复它必需的是高强度低密度的金属材料，而洛基之铠正好提供了完美的样本，得益于海勒丁的财力和人力，这一工程已近完成。这时真正的大野心家的出现了，约卡杀死了海勒丁，并恶狠狠地告诉萨尔瓦多，你将作为杀死领袖的凶手而被追杀终生，而我要利用你父亲为我建好的海上要塞成为不仅仅是海洋，同时也是陆地上的霸主。面对扬长而去的约卡，海勒丁把自己的爱剑——魔剑古拉姆留给了儿子。
９、决战
Where：亚马逊河流域
When:45000
Who：约卡、沃尔夫
How :1、在里斯本的旅店里遇见加斯巴尔。
2、在*开云港*的船厂救出沃尔夫博士并送回汉堡（沃尔夫博士告之，他已经研究出臼炮，以后在汉堡港就可以装备臼炮了）。
3、编制决战用的舰队，如果航程不够从欧洲到南美的话，可以从非洲最西的港口出发，利用信风直驶****，大约10天左右，然后再转往亚马逊河流域，决战用船当然是大型轮船级最好（汉堡商业指数均达1000时可造），再装备上究级大炮（臼炮），决战时会较为轻松。
4、要塞战时应首先在要塞的射程外击溃敌三艘拖曳舰只，然后全速接近要塞进行接舰战，待6个要塞炮位哑掉之后即可轻易做掉约卡。
Wny ：沃尔夫博士被抓走是为了让他开发最新式的大炮，因此这时的海上要塞可谓是披坚执锐，消灭了约卡，怅然而去的萨尔瓦多遇上了刚刚打败马丁内斯一伙的约翰·法雷尔和卡特琳娜，在他们看来，是他们自己摧毁了马丁内斯等人的野心，虽然事实上并非如此。与他（她）们不同，萨尔瓦多在成就当年梦想的同时几乎已失去了一切……
Ｅnd——若干时间后：塞乌塔，酒吧内
瑞贝卡:“安娜，有什么新的悬赏吗？”
安娜:“有！萨尔瓦多·雷依斯，赏额100万，生死勿论。”
瑞贝卡拿起画像看了几眼，而后又还给了安娜。
“不像。”瑞贝卡转身向门外走去，那声音仿佛是在自言自语:“真
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